Η βρογχοσκόπηση και ο ενδοβρογχικός υπέρηχος είναι μια ασφαλής εξέταση με μικρό ρίσκο και σπάνιες επιπλοκές. Συνήθως διενεργείται σε ασθενείς για διερεύνηση ευρημάτων στην ακτινογραφία θώρακος και στην αξονική τομογραφία θώρακος αλλά και σε άλλες καταστάσεις όπως είναι κάποιες ειδικές λοιμώξεις, η αιμορραγία από το αναπνευστικό και η διερεύνηση νοσημάτων του πνεύμονα. Το βρογχοσκόπιο, ένας μικρού διαμέτρου εύκαμπτος ελαστικός σωλήνας εισέρχεται από την μύτη ή το στόμα του ασθενή και διαμέσου του λάρυγγα και των φωνητικών χορδών εισέρχεται στην τραχεία. Μέσω μιας κάμερας στο άκρο του βρογχοσκοπίου ο ιατρός μπορεί να επισκοπήσει την τραχεία και όλους τους βρόγχους δηλαδή τους αεραγωγούς που καταλήγουν στον πνεύμονα του ασθενή και να λάβει υλικό για βιοψία ή ειδικές καλλιέργειες και εξετάσεις. Επιπλέον μπορεί να ληφθεί υλικό από λεμφαδένες που εμφανίζουν κάποιου είδους παθολογία δια μέσω λεπτής βελόνης. Η διάρκεια της εξετάσεις συνήθως δεν ξεπερνά τα 35-40 λεπτά και δεν χρειάζεται νοσηλεία (εκτός αν υπάρξει κάποια επιπλοκή). Γίνεται με τοπική αναισθησία και μέθη.